课 程 名 称

分子与进化生态学

课程性质

专业必修

实验技术人员

刘清梅

职    称

实验师

授 课 方 式

多媒体辅助教学

考试方式

实验报告

教       材

自编教案

出 版 社

自编

年 级

2016级

授课

专业

生态学

人数

22

学 时

18

周学时

周

日  期

实验内容及所用药品和仪器

教 师

5

基础实验一  DNA测序数据处理与分析

实验内容：学习DNA测序数据的特点、预处理及相关基本分析方法。

药品和仪器：计算机（GENEIOUS R11、MEGA7等软件）

钱增强

7

基础实验二  微卫星位点的信息学分析与开发

实验内容：学习如何从基因组测序数据扫描得到微卫星位点，分析其数量及组成特征，并设计可供后续实验筛选的微卫星引物。

药品和仪器：计算机（GENEIOUS R11、SciRoKo、FastPCR、Excel等软件）

钱增强

9

基础实验三  利用分子标记数据估算常用群体遗传学参数

实验内容： 学习分子标记数据的输入格式规范，掌握常用群体遗传学参数的计算。

药品和仪器：计算机（GenAlEx、Structure、Excel等软件）

钱增强

11

基础实验四  利用分子数据构建系统发育树

实验内容： 学习如何利用分子标记（包括DNA序列）数据构建UPGMA、NJ、MP、ML、BI等常见系统发育树。

药品和仪器：计算机（GENEIOUS R11、MEGA7、MrBayes、TOPALi、Photoshop等软件）

钱增强

13

综合实验  植物群体遗传学研究

实验内容： 利用上述所学知识和技能，对实际研究案例数据进行综合分析，撰写规范的研究报告。

药品和仪器：计算机（GenAlEx、MEGA7、Excel等软件）

钱增强